鸡自身因素。孵化率受遗传的控制，所以鸡的品种不同，孵化率也有所不同。鸡的年龄对孵化率也存在着一定的影响，一般刚开产时产的种蛋孵化率较低，在产蛋高峰期时所产的种蛋孵化率较高，之后则随着年龄的增长而呈下降的趋势。另外鸡体的健康程度会直接影响种蛋的孵化率，当鸡患某些传染病时会影响种蛋的质量，因此对于患有传染病的鸡所产的鸡蛋不留为种蛋用。

饲料营养因素。日粮中的营养水平对鸡的产蛋量、种蛋的质量以及受精率和孵化率都有着直接的作用。日粮中的能量、蛋白质、维生素、矿物质等营养物质的含量不足或者配比不合理都会使种蛋的孵化率下降。尤其是维生素和矿物质的水平对孵化率的影响更为明显。

种蛋方面因素。影响孵化率的种蛋方面因素较多，主要包括种蛋的质量和种蛋的保存方法两个方面。种蛋的质量主要有蛋重、蛋形、蛋壳的结构、清洁度等因素，这些都会对孵化率造成影响。蛋重是影响孵化率的重要因素，蛋重过大或过小都会使孵化率降低，不同品种的鸡的蛋重不同，因此最佳蛋重范围因品种的不同而存在着差异。蛋壳的薄厚程度以及结构对孵化率的影响较大，蛋壳过厚，会使内外气体交换能力差，导致胚胎闷死，蛋过过薄则会导致微生物入侵影响孵化。受到污染的种蛋的气孔被堵塞，影响气体交换，会导致胚胎死亡;种蛋的保存不当是影响孵化率的重要因素之一，保存种蛋的环境是否适宜对种蛋的孵化率影响很大，其中包括温度、湿度等环境因素。另外，种蛋的保存时过长会使孵化率下降。

孵化条件。孵化条件是否适宜影响着种蛋的孵化率。其中温度是影响种蛋孵化最重要的条件。孵化的温度过高或过低对种蛋的孵化率有着很大的影响，温度过高，会导致孵化时间短，胚胎发育过快，死亡率升高;温度过低，则胚胎发育迟缓，同样会导致死亡率增加。孵化的湿度对孵化率也存在着一定的影响，适宜的湿度有利于雏鸡出壳。另外良好的通风换气，特别是在孵化的后期，可以提高种蛋的孵化率。日常的管理。种蛋日常的管理工作对孵化率起着关键的作用，在种蛋的管理、运输、消毒等环节，如果管理不当，都会影响孵化率，因此在实际生产中，为了提高孵化率，必须加强种蛋的管理工作。